Die beiden bisherigen Kommandeure kamen jeweils aus einer der beiden tragenden Säulen der NCF. Der erste Kommandeur, James Babbage, stammte aus dem Nachrichtendienstbereich: Er war knapp 30 Jahre lang Mitarbeiter des GCHQ, bevor seine Identität Anfang 2023 offiziell bestätigt wurde — zeitgleich mit der Veröffentlichung des ersten öffentlichen Doktrinpapiers der Einheit.
Babbage führte die NCF bis später im selben Jahr und wechselte anschließend zur National Crime Agency, wo er derzeit als Director General for Threats die Bekämpfung schwerer und organisierter Kriminalität verantwortet. Sein Nachfolger, Air Vice-Marshal Tim Neal-Hopes, kam im Oktober 2023 aus den Streitkräften, wo er beim Strategic Command als Direktor für Cyber, Nachrichtengewinnung und Informationsintegration tätig war.
Die weiteren beteiligten Partner der NCF — der Auslandsnachrichtendienst Secret Intelligence Service (MI6) und das Defence Science and Technology Laboratory — haben bislang keinen Kommandeur gestellt. Ob sich das mit der neuen Besetzung ändert, ist wegen der ausstehenden Namensnennung offen.
In ihrem Papier von 2023 stellte die NCF das Land als „verantwortungsvolle und demokratische Cybermacht" dar. Ihre offensiven Operationen seien — anders als die als rücksichtslos bezeichneten Angriffe, die die britische Regierung Staaten wie Russland und China zuschreibt — „rechenschaftspflichtig", „präzise" und „kalibriert".
Das Dokument führte zugleich die von ihr so genannte „Doktrin der kognitiven Wirkung" ein, blieb aber vage dabei, wie ethische Maßstäbe bei Cyberoperationen praktisch angewandt werden. Viele dieser Einsätze gelten als notwendigerweise verdeckt, weil Geheimhaltung für die beabsichtigte Wirkung als unverzichtbar angesehen wird.
Parallel zum Führungswechsel läuft der Aufbau des künftigen dauerhaften Hauptquartiers: Ein eigens errichteter Campus in Samlesbury in Lancashire soll die Einheit beherbergen; die Planungen kamen nach Angaben aus diesem Jahr „wie vorgesehen" voran. Die staatliche Finanzierung der NCF ist bis 2030 zugesagt.